李瑞芳，女，1971年10月，博士，毕业于中山大学,二级教授，博士生导师，河南省特聘教授，河南省学术技术带头人，河南省高层次人才，河南省优秀硕士学位论文指导教师。美国加州大学戴维斯分校访问学者，新加坡南洋理工大学访问学者。主要从事人工智能与生命科学的交叉学科研究。致力于应用深度学习、计算生物学和生物化学方法，试图揭示蛋白质及多肽序列、结构和功能的关系，开展蛋白质及多肽结构和功能设计，进行基于人工智能的药物设计方法与应用研究。发表学术论文110余篇，其中SCI收录51篇；获国家授权发明专利6项，计算机软件著作权3件；主持国家自然科学基金面上项目3项，省部级项目10余项；出版专著1部，教材4部。荣获河南省科技进步二等奖1项，河南省教育厅科技成果一等奖2项、二等奖1项，河南省郑州市科技进步二等奖1项。
联系邮箱：lrf@haut.edu.cn
招生学科：智能科学与技术、人工智能、计算机科学技术、信息与通信工程、电子信息。
一、代表性论文
1. Kedong Yin, Ruifang Li*, Shaojie Zhang, Yiqing Sun, Liang Huang, Mengwan Jiang, Degang Xu, and Wen Xu. Deep learning combined with quantitative structure-activity relationship accelerates de novo design of antifungal peptides. Advanced Science. 2025, 2412488 (SCI中科院1区, TOP期刊)
2. Shaojie Zhang, Yiqing Sun, Kedong Yin, Jinhua Zhang, Lingguang Du, Shusong Wang, Dongge Zheng, Ruifang Li*.ML-AMPs designed through machine learning show antifungal activity against C. albicans and therapeutic potential on mice model with candidiasis. Life Science. 2025,366:123485. (SCI中科院2区, TOP期刊)
3. Kedong Yin, Wen Xu, Shiming Ren, Qingpeng Xu, Shaojie Zhang, Ruiling Zhang, Mengwan Jiang, Yuhong Zhang, Degang Xu, Ruifang Li*. Machine learning accelerates de novo design of antimicrobial peptides. Interdisciplinary Sciences: Computational Life Sciences. 2024,16:392–403(SCI中科院2区)
4. Ruifang Li*, Jiasha Wu, Fuyang He, Qingpeng Xu, Kedong Yin, Shang Li, Weitong Li, Ao Weia, Lan Zhanga, Xin-Hui Zhang, Beibei Zhang. Rational design, synthesis, antifungal evaluation and docking studies of antifungal peptide CGA-N12 analogues based on the target CtKRE9. Bioorganic Chemistry, 2023，132,106355 (SCI中科院1区, TOP期刊)
5. Ruifang Li*, Xuxia Wang, Kedong Yin, Qingpeng Xu, Shiming Ren, Xueqin Wang, Zichao Wang, Yanjie Yi. Fatty acid modification of antimicrobial peptide CGA-N9 and the combats against Candida albicans infection. Biochemical Pharmacology. 2023, 211:115535. (SCI中科院2区, TOP期刊)
6. Kuiming Zou, Kedong Yin, Shiming Ren, Ruiling Zhang, Lan Zhang, Yingyuan Zhao, Ruifang Li*. Activity and mechanism of action of antimicrobial peptide ACPs against Candida albicans. Life Science. 2024,350:122767. (SCI中科院2区, TOP期刊)
7. Ruihua Li, Huiping Gao, Ruiling Zhang, Beibei Zhang, Xueqin Wang, Xinhui Zhang, Ruifang Li*. Biocompatible formulation of a hydrophobic antimicrobial peptide L30 through nanotechnology principles and its potential role in mouse pneumonia model infected with Staphylococcus aureus. Colloids and Surfaces B: Biointerfaces. 2024,236:113823.(SCI中科院2区, TOP期刊)
8. Beibei Zhang, Lianfeng Mo, Rong Huang, Ge Chen, Siyi Yang, Xu Zhang, Mengmeng Sang, Yingying Zhao, Zesheng Li, Ruifang Li*, Lianzhong Zhang, Yongchao Wang. Ultrasound-enabled sonogenetics: pioneering advances in cancer theranostics. Advanced Functional Materials. 2024, 2418748. (SCI中科院1区, TOP期刊)
9. Ruirui Zhang, Ruifang Li*, Lan Zhang, Ge Chen, Lianfeng Mo, Ru Jiang, Xiaoxia Xu, Xueqin Wang, Yingyuan Zhao, Lianzhong Zhang, Yongchao Wang, Beibei Zhang. A dual-mechanism based nutrient partitioning nanoregulator for enhanced immunotherapy against anti-PD‑1 resistant tumors. ACS Nano. 2023,25;17(14):13461-13473. (SCI中科院1区, TOP期刊)
10. Xiaoge Hou, Ming Hui, Zhongke Sun, Xuesi Li, Xin Shi, Ran Xiao, Junfei Wang, Long Pan, Chunmei Pan, Ruifang Li*. Associations between wheat varieties and the functional microbial community of nongxiangxing daqu from northern China. LWT-Food Science and Technology. 2023,185:115119. (SCI中科院1区, TOP期刊)
二、主持或参加科研/教研项目（课题）
1.国家自然科学基金项目：可解释深度学习驱动的特异性抗菌肽理性设计及抗菌谱拓展研究.（主持）
2. 国家自然科学基金项目：动物源抗真菌肽CGA-N46降低真菌线粒体膜电位分子机制研究.（主持）
3. 国家自然科学基金项目：动物内源性多肽CGA-N46抗真菌作用机制研究.（主持）
三、授权发明专利
1. 李瑞芳，赵佳瑞，常俊朋. 一种新型广谱抗菌肽SAMP1-A3及其制备方法（ZL201811564473.9）,中国发明专利，2022年3月15日.
2. 李瑞芳，石薇妮，常俊朋. 一种新型广谱抗菌肽SAMP1-A4及其制备方法（ZL201811565178.5）,中国发明专利，2022年3月11日.
3. 李瑞芳，贺松林，黄亮，张贝贝. 一种新型高效抵抗蛋白酶水解抗多药耐药菌的抗菌肽辛酸偶联物及其应用（ZL202110152455.5）,中国发明专利，2021年10月8日.
4. 李瑞芳，常俊朋，陈晨. 一种新型杀念珠菌多肽FCP1及其制备方法（ZL201810211351.5）,中国发明专利，2021年4月6日.
四、计算机软件著作权
1.抗菌肽序列分析软件V1.0(2023SR0222661), 原始取得, 全部权利, 2023年2月10日.
2.抗菌肽序列辅助设计软件V1.0(2019SR1116578), 原始取得, 全部权利, 2019年11月05日.
3.抗菌肽库设计软件V1.0(2018SR696564), 原始取得, 全部权利, 2018年8月30日.
五、获得学术奖励
1. 李瑞芳.新型抗菌肽创制关键技术及其应用，河南省教育厅科技成果一等奖，豫教[2024]07304号，2024年6月.
2. 李瑞芳.一种新型结构的抗菌肽发现及其作用机制. 河南省教育厅科技成果一等奖，豫教[2022]21530号，2022年6月.
3. 李瑞芳.枯草芽孢杆菌BS501a抗稻瘟病技术研究. 郑州市科技进步二等奖，2013-J-26-R01/10， 2013年7月8日.
4. 李瑞芳.新型储粮害虫诱捕技术的研究与应用. 河南省教育厅科技成果二等奖，豫教[2008]06816号，2008年8月.
5. 李瑞芳.嗜酸乳杆菌亚油酸异构酶的分离纯化、性质及酶基因克隆研究，河南省科技进步二等奖，2008-J-073-R04/10,2008年11月.
六、指导学生获奖
1. 尹柯栋，张博，张少杰，等. 国“肽”民安——AI驱动抗菌肽精准设计,无抗时代先行者. 第十四届“挑战杯”秦创原中国大学生创业计划竞赛，国家级银奖，2024年12月.
2. 尹柯栋，张少杰，郭硕，等. 横扫千“菌”——AI赋能抗菌肽精准设计. 中国国际大学生创新大赛(2023)，国家级铜奖，2023年12月.
3.尹柯栋，邓棋午，裴南琪，等. 基于关联规则挖掘的新型抗菌肽智能设计. 第十五届“挑战杯”河南省大学生课外学术科技作品竞赛一等奖，2021年6月.
4. 许清朋，任世铭，何付阳，等. 基于机器学习的新型抗菌肽智能设计，第十六届河南省“挑战杯”大学生课外学术科技作品竞赛三等奖, 2023年7月.
5. 陈思佳，孟凯，尹柯栋，等. 从头设计抗菌肽候选药物的软件开发及生物学效应研究. 第十四届“挑战杯”河南省大学生课外学术科技作品竞赛三等奖，2019年6月.
